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第123章 种质信息管理

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一、种质信息管理

种质资源的保存,除资源材料本身外,还应包括种质资源的各种资料,对每份资源材料均应有其档案,档案资料在条件许可时,应输入计算机储存,建立数据库,以便于资料检索、分类和开展有关的研究工作。

目前,世界上不少国家和国际农业研究机构都相继建立了种质信息计算机管理系统。尽管其规模、组织和功能方面存在差异,但它们的作用大体相同。

我国已建成国家作物种质资源信息系统(cGRIS)

1、种质数据类型

基础数据:包括登记材料数据和搜集数据、登记材料号、采集编号

鉴定和评价数据 :植物学性状、经济性状、品质性状、对病虫害的反应、对环境的适应性

管理数据 :包括接纳日期、种质编号、入库定位种子起始发芽率等等。

交换数据: 交换目录内有关种引进和分发的数据。

2、种质信息系统类型

种质信息系统按其主要特征分为三类:

(1)文件系统

(2)数据库系统

(3)网络系统(美国的GRIN)

3、植物遗传资源协作网:在国际上建立起来的种质信息管理与交换系统。建立植物遗传资源协作网目的是利用长期种质库妥善保存种质资源,通过数据库系统提供信息和资料,并借助中期库分发种质资源。

(1)地区协作网

(2)作物协作网

(3)长期库协作网

(4)以课题为基础的协作网

二、核心样品的建立

1、核心种质的含义

澳大利亚科学家Frankel(1984)首次提出了核心收集品的概念,并与brown(1989)对其做了进一步发展和完善。核心样品(corecollection):是指用最小的种质资源样品量最大程度的代表种质资源的遗传多样性。

一般来说,一个物种的核心种质约占其全部种质的5-10%,至少代表该物种70%的遗传多样性 。

IbpGR(国际植物遗传资源委员会)认为,核心种质库是能以最少的重复代表一个种及野生近缘种的形态特征、地理分布、基因与基因型的最大范围的遗传多样性。

近年来,核心种质的概念已延伸到无性繁殖作物、dNA种质库及种质资源的原位保存研究领域

核心种质应具有异质性、多样性、代表性、实用性和动态性

2、构建核心种质的方法

核心种质的构建有以下几种方法:

(1)按产地来源进行构建

(2)按分类系统进行构建

(3)按农艺性状表现进行构建

(4)利用分子标记进行构建

以上方法结合使用,构建核心种质更为准确

3、建立核心样品的程序

(1)资料收集:从种质信息管理系统

(2)分组:将具有相似性状的样品归为一类, 逐级分类,没有资料的样品单独分组。

(3)选择:即确定每组选择的数量和对象

(4)建立核心样本(库):对选择出来的核心样品进行鉴定,确保它们是来自不同组的代表,繁殖核心样品,建立该种作物核心种质库。

建成的核心种质库需不断完善、更新

4、发展核心种质应注意的几个问题

(1)核心种质不能替代整个种质搜集品。

(2)核心种质的构建需要多学科的交叉知识。

(3)核心种质的构建还没有一套成型的理论。

5、核心种质构建的现状:

目前全球已对50多种作物进行了相关研究,其中野生大豆、花生、苜蓿等30多种植物已经或正在建立核心种质 。我国对大豆、栽培稻立项

种质资源的鉴定和评价的原则

1、取样的代表性和典型性

取样是指从每一实验小区抽取若干植株或器官组成一个样本,样本的观察值作为整个小区的估计值。

A 顺序取样法、b 简单随机取样法、c 典型取样法、d 分层取样法、E 带状取样法

2、尽量减少环境误差

3、要有几年的持续试验

4、正确分析性状间的关系

5、先进技术和多种方法的综合应用

第一节 生物学鉴定

一、植物形态特征鉴定

在植物种质的各生育阶段,对植株各器官(根、茎、叶、花、果实等)的基本形态进行观察和描述,并参照植物学形态描述的标准和术语进行记载。包括外观的形状、大小、颜色、色泽以及必要的度量记载。

不同的植物,其形态特征鉴定中描述记载的项目有差异。

包括质量性状和数量性状

1、质量性状的描述

(1)二型编码法:用于主基因控制,且只有两种表型的质量性状,以“-”和“+”分别表示隐性和显性类型,如豌豆的花色(红花和白花),小麦的红粒和白粒,水稻的粳型和糯型,油菜的黄花和白花。

(2)三型编码法:用于不完全显性或存在显隐中间类型的质量性状,以“-”、“m”和“+”分别表示隐性、中间和显性类型。如紫茉莉的花色,红色、粉红色和白色,株高常常是不完全显性性状,桃、杏等核果的离核、半粘核和黏核。

(3)级次编码法:用于极端类型之间有若干质态的质量性状。如黄瓜的性别分强雌株、雌株、雌全株、雌雄全株、雌雄株、完全株、雄全株、纯雄株等。

2、数量性状的描述

(1)级差归类法:用于容易计数和测量的性状和比值性状。如株高、果重、果径、叶长、裂叶数、果形指数、叶形指数、根冠比、结角指数等。

(2)图示分级法:有些连续变化的性状,可用示意图归类,并常用典型品种做参照。如株型,白菜生长状态分1直立,2开张,3半塌地,4塌地等类型。

(3)选择归类法:有些复杂性状难以根据单一因素排列成有序级次,可按表型分成若干类型。如油菜的种皮色,可分成黑、黑褐、褐、褐红、褐黄、黄、浅黄等。

(4)模糊归类法:有些性状只能根据表现的状态进行模糊归类。如大白菜结球紧实度可分为1特松、2松、3中等、4紧、5特紧等类型。植物叶表面的茸毛分1疏、2中、3密。

二、生物学特性鉴定

生物学特性:植物种质对所生存的生态环境,经自然选择和人工选择、长期适应而形成的各自的生态特点。即种质材料在生长发育过程中对温度、日照长短、光照强度、水分、土壤的物理结构和化学组成等环境因素要求,以及对这些因素变化的忍耐程度。

生物学特性鉴定的记载内容

(1)环境因素

(2)物候期

(3)植物体生长发育状况

重点在于种质材料在特定环境条件下的生育情况。

生物学特性的鉴定方法主要分两种

1、自然环境鉴定

二、生物学特性鉴定

1、自然环境鉴定

(1)区域鉴定 :利用不同地区的地理条件、土壤条件以及温度、光照、雨量等气候因素的差异,栽培植物种质材料,观察其生育状况,以鉴别种质材料在不同地区的适应性,以及不同品种、变种和种间生物学特性的差别。

(2)季节鉴定:鉴定种质材料对季节的适应性。如分春秋两季栽培,鉴定种质对不同季节的适应性。

同一种作物,有的品种适宜春季栽培,有的适宜秋季栽培。

鉴别种质材料的季节适应性,才能进行合理利用,充分发挥其生产潜力。

2、人工控制环境下的鉴定

在大棚、温室、人工气候室或人工气候箱中,通过人工控制环境条件,即人工促成类似季节变化的小气候变化,栽培植物种质材料,鉴别种质材料对单个因子或复合环境因子的最适范围,以及所能忍耐的极限。

人工控制环境的鉴定优点:

人工控制环境条件,各环境因子完全在人工控制下发生,可以比较准确的鉴定植物不同种、类型及品种间对春化温度的感应和所需时间的差异,对光强和光周期的适应性。

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